Разве взаимозаменяемые?
Джим - уменьшительное от Джеймс, а еще Джеймс - то же имя, что Джейкоб (понять, как такое может быть, я даже не пытаюсь). Но Джон - это совсем отдельное имя. По-моему, никогда не слышала, чтобы Джона называли Джимом. С Джоном Кеннеди (который JFK) действительно забавно, только его называют вроде не Джим, а "Джек Кеннеди". Но, кажется, это исключение, а не стандартная замена.
(Или это все было в шутку? :)