>. Это вопрос не мнений, а измерений, они там умеют определить долю неандертальских генов с точностью в доли процента
это красивый картонный фасад, на потемкинской избе
ну, давайте быстренько глянем как же у них там с точностью на самом деле, на полметра за фасадом берем первое попавшееся количественное исследование(честное пионерское -- случайно ткнул, полчаса назад не подозревал о существовании) http://www.nature.com/nature/journal/v507/n7492/full/nature12961.html
там читаем: For a haploid genome in a test population that carries Neanderthal ancestry (for example, Europeans), given the allelic states of a sequence of SNPs along this haplotype, we wish to infer the ancestral state of the allele at each SNP; specifically, whether it has entered modern humans through Neanderthal gene flow. In addition to the test haplotype, the data analysed consist of a panel of haplotypes from the sub-Saharan-African Yoruba (YRI) who we assume harbour no Neanderthal ancestry. ну и так далее, я не буду все методы цитировать
и переводя с псевдонаучно английского на простой русский: написано, что разные варианты в геноме оценивались по снипам и которых снипов в африканских геномах нету, те значит аллели неандартальские. логичненько, ведь человек произошел африке, а там неандертальцев и не было. теперь посмотрим, а откуда же у них африканские геномы. а вот отсюда: http://www.nature.com/nature/journal/v491/n7422/full/nature11632.html а откуда в тамошних геномах снипы? честно написано: "Of these, 1,001 (CEU) and 669 (YRI) were validated by re-sequencing the cell line DNA. When these were tested for segregation to offspring (CEU) or in non-clonal DNA from whole blood (YRI), only 49 CEU and 35 YRI candidates were confirmed as true germline mutations."
"We infer that the remaining vast majority (952 CEU and 634 YRI) of the validated variants were somatic or cell line mutations. The greater number of these validated non-germline mutations in the CEU cell line perhaps reflects the greater age of the CEU cell culture." http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7319/full/nature09534.html#/mutation-recombination-and-natural-selection
я очень сомневаюсь, что вообще существуют методы математического анализа, позволяющие как угодно работать с этой кучей грязи. но авторы тестируемого исследования идут много дальше, они трактуют ее ... как что? да как свидетельство не неандардальского происхождения участка генома, конечно: "The second feature is 1 if at a given SNP the test haplotype carries a derived allele that is polymorphic in the panel of African individuals but absent in the Neanderthal. SNPs with this joint configuration have a decreased likelihood of Neanderthal ancestry."
no subject
это красивый картонный фасад, на потемкинской избе
ну, давайте быстренько глянем как же у них там с точностью на самом деле, на полметра за фасадом
берем первое попавшееся количественное исследование(честное пионерское -- случайно ткнул, полчаса назад не подозревал о существовании)
http://www.nature.com/nature/journal/v507/n7492/full/nature12961.html
там читаем:
For a haploid genome in a test population that carries Neanderthal ancestry (for example, Europeans), given the allelic states of a sequence of SNPs along this haplotype, we wish to infer the ancestral state of the allele at each SNP; specifically, whether it has entered modern humans through Neanderthal gene flow. In addition to the test haplotype, the data analysed consist of a panel of haplotypes from the sub-Saharan-African Yoruba (YRI) who we assume harbour no Neanderthal ancestry. ну и так далее, я не буду все методы цитировать
и переводя с псевдонаучно английского на простой русский: написано, что разные варианты в геноме оценивались по снипам и которых снипов в африканских геномах нету, те значит аллели неандартальские. логичненько, ведь человек произошел африке, а там неандертальцев и не было. теперь посмотрим, а откуда же у них африканские геномы. а вот отсюда:
http://www.nature.com/nature/journal/v491/n7422/full/nature11632.html
а откуда в тамошних геномах снипы? честно написано:
"Of these, 1,001 (CEU) and 669 (YRI) were validated by re-sequencing the cell line DNA. When these were tested for segregation to offspring (CEU) or in non-clonal DNA from whole blood (YRI), only 49 CEU and 35 YRI candidates were confirmed as true germline mutations."
"We infer that the remaining vast majority (952 CEU and 634 YRI) of the validated variants were somatic or cell line mutations. The greater number of these validated non-germline mutations in the CEU cell line perhaps reflects the greater age of the CEU cell culture."
http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7319/full/nature09534.html#/mutation-recombination-and-natural-selection
я очень сомневаюсь, что вообще существуют методы математического анализа, позволяющие как угодно работать с этой кучей грязи. но авторы тестируемого исследования идут много дальше, они трактуют ее ... как что? да как свидетельство не неандардальского происхождения участка генома, конечно:
"The second feature is 1 if at a given SNP the test haplotype carries a derived allele that is polymorphic in the panel of African individuals but absent in the Neanderthal. SNPs with this joint configuration have a decreased likelihood of Neanderthal ancestry."