i_eron

О-о, в 2006 году у компании Солекса (спин-офф Кембриджского факультета химии, "британские учёные", да) заработал совершенно новый метод. Я его понимаю только в самых общих чертах, лучше спрашивать биохимиков/генетиков. Солекса присобачила олигонуклеотиды хвостами к поверхности стекла. Такие короткие синтезированные последовательности нуклеотидов. Наструганные кусочки искомой ДНК присоединяются к ним своими концами, потом размножаются в кластеры из сотен одинаковых кусочков, потом к каждому пошагово присоединяют ровно по одному нуклеотиду вместе с флюоресцентным маркером (четыре сорта нуклеотидов, четыре сорта маркеров), светят ярким зелёным светом и смотрят камерой, которые из кусочков светятся красным - это те, к которым присоединился данный нуклеотид. Читают последовательность ДНК в кусочках буква за буквой. Поверхность стекла позволила делать всё это не в бутылочке, а на эдаком химическом чипе, автоматизировать химические шаги (налить, щёлкнуть, смыть, повторить) и смотреть параллельно на много таких кластеров. Первые устройства могли читать только очень короткие последовательности и делали много ошибок. В конце 2006 их купила Иллюмина и стала оптимизировать эти машины и продавать их исследовательским группам.

В первый момент далеко не все в генетике понимали, насколько это революционный метод, и что надо плюнуть на другие способы и вложить всё в этот. Сванте Пяябо с его грантом получил одну из первых машин, фидбек его группы (и других тоже, конечно) помог Иллюмине в оптимизации (увеличение длины кусков, уменьшение числа ошибок, увеличение скорости). Они были заинтересованы делать оперативные апгрейды его машин, а он параллельно улучшал свои методы обработки неандертальских костей, из которых доставали кусочки ДНК, и методы анализа результатов (не так-то просто объединить распознанные кусочки в одну правильную последовательность в условиях шума и примесей). Основная часть доведения всех этих частей технологии происходила в 2007-2009 годах, первая знаменитая статья о неандертальцах вышла в 2010.